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下の例はウマのデオキシヘモグロビン(出典: PDB 2DHB)。
鉄原子 (黄土色) が 6つの窒素原子(青色)に配位されている。4つはヘム上にあり、1つは蛋白質のヒスチジン残基にある。酸化状態では、酸素分子がヒスチジンの反対側から軸配位子として結合する。
注意: この例では、サーバから PDBファイルを XmlHttpRequest を使って読 み込みます。 Same-Origin-Policy による制約のため、このファイルをローカルディスクに保存しても動作しませ ん。GLmol は、HTML ファイルと同じWebサーバか、Ajax を許可したサーバ (PubChem, RCSB PDB など) から座標を読み込むことができます。
下の例はトリヨードチロキシン。
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